Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrhQ62361 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrhQ62361 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms