Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sin3bQ62141 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms