Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms