Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms