Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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