Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms