Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms