Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atf3Q60765 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms