Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mkrn3Q60764 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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