Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms