Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms