Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms