Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms