Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms