Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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