Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

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Length 973 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf20Q5DTM8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf20Q5DTM8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf20Q5DTM8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf20Q5DTM8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf20Q5DTM8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf20Q5DTM8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf20Q5DTM8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf20Q5DTM8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf20Q5DTM8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf20Q5DTM8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf20Q5DTM8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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