Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms