Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tigd5Q499M4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms