Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms