Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc185Q3V118 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ccdc185Q3V118 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ccdc185Q3V118 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ccdc185Q3V118 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc185Q3V118 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc185Q3V118 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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