Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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