Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms