Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms