Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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