Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms