Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms