Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms