Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Q3U6N9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Q3U6N9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Q3U6N9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q3U6N9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms