Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U595 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U595 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms