Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vars2Q3U2A8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vars2Q3U2A8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms