Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms