Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms