Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2f1Q3THK3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms