Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms