Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms