Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1aQ2LKU9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms