Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms