Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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