Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms