Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Cers3Q1A3B0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Cers3Q1A3B0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cers3Q1A3B0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms