Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms