Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r181Q0P547 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms