Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms