Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MestQ07646 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MestQ07646 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms