Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms