Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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