Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms