Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms