Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs3Q05895 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms