Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms